Многие
патогены, особенно вирусы, не могут существовать сами по себе, а только в
организмах хозяев. Нечего удивляться, что судьбы двух видов, паразита и хозяина,
оказываются очень тесно связаны. Ученым из Висконсинского университета в
Мэдисоне удалось проследить пути
распространения по свету и ход эволюции вируса
простого герпеса первого типа (HSV-1). Оказалось,
что его судьба полностью совпадает с судьбой человечества, какой она выглядит
по археологическим, генетическим и лингвистическим данным.
Предполагается,
что первые люди появились в Африке, были там
довольно многочисленны, затем небольшая группа перебралась на Ближний Восток,
оттуда часть отправилась в Европу, а часть в Азию. Из Азии через Берингов перешеек, который был тогда сушей, а
вовсе не проливом, люди попали в Америку. Из Юго-Восточной Азии первобытные
мореплаватели колонизировали Австралию и Океанию. Похоже, что весь этот путь
вирус герпеса проделал вместе с человеком.
Вирус герпеса
обладает рядом свойств, повышающих вероятность совместной эволюции с людьми.
Во-первых, он редко вызывает заболевания с тяжелым течением, чаще всего
симптомы сводятся к высыпаниям на губах и скоро проходят. При этом вирус
остается в организме на всю жизнь. Чаще всего передача происходит при тесном
контакте, например со слюной, кроме того, вероятность заражения довольно низка,
и одного контакта обычно недостаточно. Поэтому передача обычно происходит
внутри семьи. Ряд механизмов заметно снижает вероятность попадания двух вирусов
в одну и ту же клетку, а это снижает вероятность рекомбинации, то есть
ситуации, когда в клетку попали два разных вируса, их геномы перемешались, и
получился новый, унаследовавший часть генов от каждого из «родителей».
Вирус герпеса
мутирует, как и все вирусы. Частота возникновения мутаций примерно постоянна и
давно известна ученым. Если в каком-то из вирусов возникла мутация, то все его
потомки будут обладать такой же мутацией, если только в этом месте снова не
произойдет мутация, но такое крайне маловероятно. Сопоставляя геномы вирусов, и
зная частоту, с которой происходят мутации, можно подсчитать, когда существовал
общий предок этих вирусов.
Поскольку
секвенирование – метод чтения геномов – становится все более дешевым и
доступным, в мировом банке данных накапливается все больше полностью
прочитанных геномов. Полностью прочитанных геномов HSV-1, полученных от разных людей, на сегодняшний день существует 31. Авторы
работы проанализировали их все. Получилось все, как и у людей. Большое
разнообразие африканских вариантов, из которых только один пробрался дальше.
Один из образцов, взятых в Америке, оказался родственным азиатским образцам,
что подтверждает гипотезу заселения Америки через Берингов перешеек. Время
расхождения, вычисленное для двух разновидностей вирусов, совпало с временем
расхождения соответствующих субпопуляций людей. Даже редкие случаи рекомбинации
не запутывали общей картины, а совпадали с существующими представлениями о
повторных встречах ранее разделившихся народов.
Кроме
очевидного фундаментального значения, у этого исследования есть и прикладное.
Дело в том, что геном человека примерно в 10 тысяч раз больше генома вируса
герпеса. Прочитать геном человека (хотя в исследованиях такого рода не читают
его полностью) гораздо дороже, а сравнить два генома – гораздо сложнее. Но
теперь получается, что читать и сравнивать можно геномы вирусов, и на этом
основании делать выводы о распространении человека по планете.